Oprogramowanie do interaktywnej analizy obrazu w Zakładzie Biologii Molekularnej i Genetyki Klinicznej

Zakład Biologii Molekularnej i Genetyki Klinicznej korzystając ze wsparcia Priorytetowego Obszaru Badawczego qLIFE zakupił oprogramowania do interaktywnej analizy obrazu. 

 

Oprogramowanie Imaris umożliwia wizualizację wielokanałowych zbiorów danych mikroskopowych oraz ich analizę ilościową (zarówno statyczne obrazy 2D jak i  szeregi czasowe  3D).

Pakiety oprogramowania Imaris oferują doskonałe algorytmy śledzenia podziałów komórkowych oraz zintegrowane narzędzia do tworzenia wykresów wszystkich pomiarów zsynchronizowanych z podziałami. Imaris umożliwia wizualizację i wirtualną analizę danych 3D oraz obejmuje różnorodne pomiary interakcji przestrzennych, takie jak: rozmieszczenie obiektów wokół powierzchni, najkrótsza odległość, nakładanie się objętości i analiza najbliższego sąsiada, analizy komórki i odkrywania relacji wewnątrzkomórkowych Wszystkie pomiary są wysoce powtarzalne i mogą być wykonane w trybie automatycznego powtórzenia tego samego protokołu analizy dla wielu próbek wraz z testami statystycznymi. Ponadto oprogramowanie oferuje  dwukierunkowy interfejs umożliwiający współpracę ze z  Matlab, Java lub Python. 

 

 

Zakup oprogramowania dokonany ze środków finansowych Priorytetowego Obszaru Badawczego qLIFE w ramach programu strategicznego Inicjatywa Doskonałości w Uniwersytecie Jagiellońskim. 


Powrót